正享受短暂假期的公安九课少校草薙素子（坂本真绫配音）突然接到巴特（松田健一郎配音）的报告，西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击，政府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下，九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人一齐出力，将恐怖分子彻底制服，但草薙在行动中不测受到神秘疫毒感染。在西之内恐怖袭击的同时，远郊的水坝发生爆震案。新滨县刑警陀古萨（新垣樽助配音）传唤水坝管理企业负责人沙特博士，对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压，陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面，草薙一方得知恐怖分子的真实角色，正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件不测联系在一起，其背后隐藏怎样的事实？本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。这部挺没意思的，看了半天觉得没什么意思，无非这是将炸弹的，在别的片子里见过，不知谁抄袭谁的。还是苹果核战记好看。从1989年，已经过去了十七个年头，攻壳3依然遥从1995年的剧场版动画，如今的时代要制作动画，无论何时都摆脱不了商业的气息，投资动画的资本家都是也将会永远以利益最大化为第一标准，对于那些经典的著作，就不说制作者不可能拒绝这样做，拿怕是制作者不愿意，这些摇钱树也没有可能只用过一次之后就永远供在神坛上而置之不理。